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首個不依賴已知抗體的AI特定表位抗體從頭設計平臺獲驗證,一鍵生成抗體時代來臨

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近日,由晶泰科技創新中心與百奧賽圖聯合創立的科邁生物科技(蘇州)有限公司宣布,由其研發的全球首個內部數據驅動的AI人源抗體從頭設計平臺獲里程碑進展,首次實現不依賴已知抗體的AI抗體從頭設計,針對指定表位僅用5天便計算獲得全新抗體起始候選分子。

進一步實驗驗證表明,這些抗體具有良好的親和力,有望在優化后作為PCC向臨床推進。科邁生物的AI抗體從頭設計平臺突破濕實驗帶來的研發局限,將傳統上需要4-6個月的研發流程縮短到數周,且更加精確高效,覆蓋傳統方法下“難成藥”的抗原靶點,為抗體藥物研發帶來范式革新。

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抗體藥由于其更強的靶向性、安全性和長效性等獨特優勢,在腫瘤、自免和病毒感染等疾病領域的治療中的應用越來越廣泛,備受藥企追捧。據分析機構Global Market Insights報道,全球抗體藥物市場在2021年已突破1861億美元,并將在未來幾年維持高增長率,預計在2028年達到4456億美元。

當前的抗體研發方法依賴小鼠免疫、噬菌體展示篩選等濕實驗手段驅動,昂貴耗時,且表位針對性不明確,不僅無法根據生物學功能與藥效靶向抗原上的特定表位,也不能對動物免疫實驗中較難產生抗體的低免疫原性表位進行研究,且后期開發中仍面臨人源性、可開發性等諸多挑戰,難以獲得理想的抗體,極大地局限了抗體藥的研發。

科邁生物立足晶泰科技創新中心的AI算法研發能力與百奧賽圖獨特的全人抗體小鼠RenMice平臺產生的高質量全人抗體序列,以此訓練的深度學習生成式模型可以模擬小鼠免疫系統抗體生成過程中的體細胞超突變(Somatic hypermutation)過程,產生具備高人源化和高親和力的優質抗體序列。

在此基礎上,科邁生物建立了一套高效的抗體從頭設計AI計算流程,通過整合一系列自主研發的抗原特異性抗體挑選、抗原表位預測、抗體親和力預測等模型與進化算法,可針對指定的抗原表位,從頭設計具有高親和力和特異性結合能力的候選抗體分子。有別于已獲報道的其他抗體從頭設計方法,科邁生物的AI抗體設計流程不依賴任何已知的目標表位結合抗體,突破性地實現從0到1的AI抗體從頭設計,極大地拓展了可成藥抗體發現的空間,有潛力支持晶泰科技的AI抗體藥發現業務。

在最近的一個測試案例中,針對訓練集中未出現過的目標表位,科邁通過 AI 計算流程從頭設計出 100 萬條抗體,并挑選 10 條進行表達,以 5 天的計算節省了幾十萬到幾百萬的抗體實驗。經多濃度 BLI 技術測定,其中 2 條抗體親和力 KD 分別達到 194 nM 和 336 nM,有很大潛力作為起始候選分子,在進一步優化和體內外實驗驗證后向臨床推進。

科邁生物的AI抗體從頭生成平臺具有速度快、準確度高、成本低的優勢,將從前需要幾個月的抗體發現流程縮短到幾周且適用于低免疫原性和難以穩定表達的GPCR等多次跨膜類靶點蛋白上的表位,將“難成藥”靶點納入研發射程,具備極高的應用價值。

同時,新抗體基于全人共輕鏈小鼠抗體數據生成,不僅具有天然的高人源化程度與優秀的可開發性,能從源頭降低后續CMC風險,還能有效解決輕重鏈錯配問題,在多特異性抗體發現中也格外具有優勢這一成果驗證了僅憑AI生成生物藥的可行性和優越性,為AI從頭設計功能性抗體的工業應用奠定基礎。

科邁生物AI抗體從頭設計平臺的成功標志著AI抗體藥研發迎來爆發點,首次驗證了AI算法超越濕實驗與已知樣本庫限制的創新潛力,能定制生成具有表位特異性和高親和力的全新抗體,從而精確滿足特定的生物學功能,拓展抗體藥適用靶點,在更廣闊的可成藥抗體序列空間創造價值。


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科邁生物董事長、CEO黃小魯表示,“本次階段性的實驗結果,驗證了人工智能從頭生成抗體序列的可行性,以及新的抗體數據支持下模型提升的巨大潛力,是晶泰科技用人工智能手段模擬免疫關鍵環節的有益探索??七~生物的數字化抗體生成技術不受體內免疫反應限制,為抗體藥摘取靶點中的‘高懸果實’提供了更加高效的全新途徑?!?/span>

晶泰科技聯合創始人、首席創新官賴力鵬表示,“科邁生物在AI抗體設計領域的突破很好地展示了高相關性實驗數據與AI相結合所能產生的巨大價值。很高興晶泰科技能深度參與其中。晶泰創新中心也將與合作伙伴們一起,持續探索AI、計算模擬及自動化技術在包括抗體設計、疫苗研發、臨床前及臨床研發中的突破與價值轉化。”

接下來,科邁生物將持續投入AI抗體平臺的開發,積累更多高質量的數據,繼續提高預測算法的效率和準確度,拓展其抗體編程能力,在更廣闊的范圍內實現更加精確的抗體從頭設計。

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 關于科邁生物  

科邁生物是一家聚焦于抗體藥物早期發現的生物技術公司,由晶泰科技和百奧賽圖于2021年6月共同出資成立,通過自主生成的高質量人源抗原抗體配對數據,打造了行業首個以數據驅動的特定表位AI抗體從頭設計平臺并獲得實驗驗證。該平臺突破性地實現在沒有動物免疫實驗、抗體篩選庫的前提下,以AI從0到1生成能與特定表位結合的抗體分子,為行業帶來第三種抗體發現來源,顯著拓展抗體藥發現的空間。


科邁生物致力于打造AI與真實數據驅動的B細胞編程平臺,探索全新的抗體藥研發模式,以AI算法模擬并超越人體的自然免疫過程,從而加速設計出靶向精確、可開發性強的抗體分子,填補臨床用藥空白,讓更加安全、高效的生物藥早日來到患者身邊。


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