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新一代抗體發現平臺XploreSeq?——利用NGS和AI挖掘BCR免疫組庫,實現超快速抗體篩選
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XploreSeq? 可分析數百萬個抗體序列并推薦高度多樣化的候選分子組合——準確率超過50%
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BCR免疫組庫規模龐大,包含許多具有成藥潛力的序列。一個典型的藥物發現項目可得到數百萬個BCR序列(如上所示)。
XploreSeq?利用經過多年訓練和完善的AI引擎篩選該免疫組庫,識別苗頭抗體,輕松應對這種大海撈針式的挑戰。
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重建抗體譜系樹(來自真實項目)
候選抗體的質量和多樣性都很重要。我們的目標是從不同譜系中挑選具有高結合置信度和極佳可開發性的抗體。這將為整個項目提供多樣化的、可開發的苗頭抗體,可以覆蓋最大數量的表位,從而提高下游篩選的成功率。
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案例 1XploreSeq?高度準確地識別苗頭抗體
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在該項目中,XploreSeq? 共預測了717個結合抗體,從中隨機選擇48個用于表達和測試。其中66.7%(32/48)被確認為結合抗體,只有18.6%(6/32)的結合抗體與雜交瘤篩選的苗頭抗體重疊。
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案例 2將XploreSeq?應用于VHH發現
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在該項目中,利用免疫噬菌體文庫以及Sanger測序共識別出41個獨特的VHH苗頭分子。
隨后對文庫進行NGS測序,并進行XploreSeq? 分析。NGS結果包括之前識別出的41個苗頭分子中的38個。此外,XploreSeq? 還預測了43個新的VHH binder。表達和測試時,上述43個分子中的30個(69.7%)被確認為是結合抗體,相比僅利用噬菌體展示獲得的苗頭抗體,其多樣性顯著提升。
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案例 3共同輕鏈雙抗的發現
輕鏈在免疫組庫中的多樣性較低,因此更有可能在不同組庫中得到共同輕鏈,構建共同輕鏈的雙特異性抗體。XploreSeq?非常適用于該應用場景,可以采集數百萬個輕鏈序列,極大地提高了找到共同輕鏈的可能性。
在本案例中,XploreSeq? 能夠在A抗原免疫組庫中識別出一條與我們通過XtraDoma? 雜交瘤平臺得到的B抗原的苗頭抗體類似的輕鏈。我們基于這兩條輕鏈直接構建出了兩種共同輕鏈的雙特異性抗體。這兩種分子能被較好表達且純度高,并同時與兩個靶點結合。